تحدثنا في السلسة السابقة عن طرق الكشف عن ال SNPs المعتمدة على التهجين (hybridization). اليوم سنتحدث عن الطرق المعتمدة على ال PCR في الكشف عن SNPs بشكل مبسط

⬅️تبسيط المفاهيم يساعد في قراءة ورقة علمية قد لاتكون معني بتفاصيل كثيرة عن الطريقة ولكن مهم على الأقل يكون عندك نبذه عنها➡️

1-The dual-probe TaqMan assay

حساسة للغاية وبالتالي فهي في القائمة المختصرة عندما يكون حجم العينة محدودًا. في التنميط الجيني TaqMan SNP ، تستخدم فيها صبغات (Dyes) توضع على المجسات (probes labeled)تعمل على فحص كلا الآليلات الموجودة في ال SNPs في آن واحد.

تابع الصورة ⏬⏬ https://t.co/V6tucbp04T

مبدأ عملها⏬⏬

Taking advantage of the 5’ nuclease activity of Taq polymerase

➡️ amplicon production releases the specific reporter dye for the amplified allele➡️ freeing it from the effect of the quenching dye. ➡️➡️enabling fluorescent signal to be emitted ???and quantified.

⭕️⭕️ To improve specificity, a minor groove binder at the 3’ ends of probes stabilizes the complementary association between probes that are a perfect match for their DNA targets. ⏬⏬

الصورة في الأسفل تشرح تفاصيل مايحدث?? https://t.co/SLZjxWJAw4

بما أن تصنيع المجسات

TaqMan SNP genotyping assay probe) يحتاج الى مختصيين ويحتاج الى دقة عالية ?

فإن ال Thermo Fisherتحتفظ بمكتبة تحتوي على ما يقارب ١٧ مليون إختبار لل SNPs...وقد تجد انت او الباحث حسب الإحتياج على واحد او أكثر منها لإجراء الأبحاث .... مشكورين على التسهيلات ??