على الرغم من تشابه بعض جوانب قصتي نبينا يونس عليه السلام ونبي الله إبراهيم -كما ورد في القرآن الكريم- فيما يتعلق بالقصة التي تتضمن الهجرة ومفارقة المجتمع، إلّا أنّ هناك فرقًا أساسيًّا أدَّى لعقاب واحد وحماية الآخر.
وفقاً لتفسير العديد من علماء الدين الإسلامي، بما في ذلك الإمام ابن عثيمين والإمام القرطبي، فإن الفارق الرئيسي يكمن في وجود الأمر الإلهي أو إذنه قبل اتخاذ الخطوة. فقد هجر إبراهيم لقومه بناءً على توجيه سماوي محدد، حيث يقول الله عز وجل في كتابه العزيز: "وقال إني ذاهب إلى ربي سيهدين". وهذا التصريح يدعم بالأدلة التاريخية والشعرية أيضًا كـ حديث صحيح البخاري حول هجرة الرسول محمد صلى الله عليه وسلم بتوجيه خاص منه سبحانه. أما يونس عليه السلام فقد فر هارباً من مكانه دون الحصول على تفويض أو ارشادات واضحة من الرب نفسه، مما جعله عرضة للعقاب الذي أخبره عنه رب العالمين قائلاً: "(وذات النون إذا خرج مغاضبا...)"، مشيرا إلى أنه قد يغادر المكان المُعين عليه بالدعوة دون موافقة مقدسة .
هذه التفاصيل تعكس أهمية التمييز الواضح بين الأوامر الإلهية والتعبّد الشخصي الحر حتى ضمن حدود إيمان المؤمن وثباته الروحي. فالرضا المطلق والخضوع الكامل لأوامر الربوبية هي أساس العقيدة الإسلامية المحضة.
